Il protagonista è Ash Ketchum, un ragazzo di Pallet (la città che nel videogioco viene chiamata Biancavilla), deciso a diventare maestro di Pokémon, ovvero a raggiungere il maggior grado di abilità come allenatore. Il giorno in cui finalmente deve ricevere il suo primo Pokémon però si sveglia tardi, e al suo arrivo al laboratorio del Professor Oak, quest'ultimo è costretto a consegnargli l'unico Pokémon rimastogli, Pikachu, che diventerà la sua inseparabile spalla.
L'anime è ufficialmente diviso in 13 serie, ognuna composta da un numero variabile di episodi che varia da 34 ad 83 (di cui 4 composte da esattamente 52 episodi). L'undicesima serie è trasmessa a partire dal 2008 sia negli Stati Uniti che in Giappone. Oltre alla suddivisioni in serie, si può fare una divisione in tre parti dell'anime.













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Prima stagione

01 L'inizio di una grande avventura
02 Emergenza!
03 Il primo Pokémon catturato
04 La sfida del samurai
05 La grande sfida
06 La Pietra Lunare
07 Il segreto di Misty
08 Impegnati e vincerai
09 La scuola per allenatori
10 Un'oasi felice
11 Un nuovo Pokémon
12 Una squadra scatenata
13 Il mistero del faro
14 Un incontro da Elettroshock
15 Un'insolita crociera
16 Il naufragio
17 L'isola dei Pokémon giganti
18 Le creature marine
18 Vacanza ad Acapulco (episodio censurato)
19 Il fantasma della scogliera
20 Una nuova vita
21 Sabrina
22 La torre della paura
23 Haunter contro Kadabra
24 Una nuova conquista
25 La città dei profumi
26 Un mistero da svelare
27 Il salone di bellezza
28 Il torneo
29 Un'amica magnetica
30 La diga
31 La valle dei ninja
32 La gara
33 Il bambino della giungla
35 - censurato in Italia La Leggenda di Dratini
34 Avventura su due ruote
35 Un Pokémon dopo l'altro
36 - censurato in Italia Soldato elettrico Porygon